彩虹飛蜥在夜晚時的體色是不顯眼的灰色，但是當太陽光照射彩虹飛蜥的體溫發生變化後，它們的體色就會變為亮眼並且非常鮮豔的顏色。
彩虹飛蜥的特點是它帶白色的下腹部， 迷棕色的後腿和尾部有一條纖細的明亮度條紋到中間和6到7個深斑到一側的條紋。有一些雌雄異體。次級雄性， 雌性，和幼體擁有一個橄欖綠的頭部。一個藍色的身體和黃色的尾巴、頭這是佔有統治地位的雄性的特徵。彩虹蜥蜴有一個大腦袋，一條長尾巴，完整發育的外耳孔和眼瞼。這種蜥蜴也有邊齒，不同類型的牙。雄性蜥蜴的最大長度是25釐米，雌性蜥蜴是20釐米（Harris 1964）。
