底砂主要是指鋪在魚缸底部的任何材質的砂石。底砂可以起到過濾的作用，維持魚缸中的水質環境。因此選購一款合適的底砂，也是保證魚兒健康成長的一個重要方面。
水族缸的底砂常見是以碎石鋪面為主，碎石不僅有能使水草根生長的功用，向且是部分硝化細菌的繁殖場，有底砂的水族缸比起沒有底砂的缸子水質更加穩定。
市場上銷售的底砂種類繁多，有菲律賓砂、珊瑚砂、矽砂等等。另外，也有自行採取的河川上游河砂、以及海岸邊的岸砂等多種選擇。
底砂的處理方式大致可分為兩個步驟，一個是去除雜質，另一個是添加肥料。在去除雜質方面只要用清水清洗潔淨即可，但添加底肥部分可就必須在清洗過後，先在缸底鋪上一層厚約2cm的基肥，接著把以底砂肥料按照3:1的比例攪拌均勻且厚約5釐米的底砂混合基肥鋪平於第一層基肥上，
選擇底砂可以按照魚缸的造景特點來選擇，同時還要根據魚兒的成長習性和對水質環境的要求，來選擇酸鹼度合適的底砂，這樣才會讓魚兒健康的成長。
