1 水體消毒藥
常用於水體消毒的藥物主要是生石灰和含氯消毒劑。含氯消毒劑包括漂白粉、漂白精等。在使用漂白粉時，其氯含量應高於30%，若在25%以下藥效會全部失去，所以在使用前必須測定含氯量。生石灰既可殺菌，又可改善水體底質，但不可於漂白粉混用，二者應交叉使用為宜。
2 預防治療藥物
該類藥物主要包括氧化劑、重金屬鹽、染料、磺胺類、抗生素、呋喃類、中草藥和疫苗等。使用十一班採取浸洗、遍灑、塗抹、口服或注射的方法。
2.1 氧化劑類 主要有甲醛、高錳酸鉀、鉻酸鉀。甲醛用於治療水黴病，使用量一般為50-100mg/kg。
2.2 重金屬鹽類 常用的有硫酸銅、硫酸亞鐵，二者按0.5mg/kg硫酸銅與0.2mg/kg硫酸亞鐵配合使用，全池噴灑或浸泡的效果佳。
2.3 染料類 包括鹼性染料和酸性染料，主要使用的是鹼性染料。如孔雀石綠，主要用於治療水黴病、白斑病，但該藥有殘留，應儘量少用。
2.4 呋喃類 呋喃西林和呋喃唑酮的共同特點是不溶于水。呋喃西林主要是外用，預防細菌性疾病；呋喃唑酮內服、外用均可，濃度適當高些，效果會更好。
2.5 磺胺和抗生素類 一般應少用。
2.6 中草藥和疫苗療法 其藥效持久，但費工費時，應根據病情儘量控制使用。
