亞馬遜泥龜在野生環境下是肉食性的龜，但是在人類飼養的時候，也會接受一些植物性的食物以及龜糧，這是一個比較好的現象，
亞馬遜泥龜食性較廣，稻穀、小麥、豌豆、小魚、蝦、昆蟲、蝸牛等均吃，其中最喜歡吃的食物是小魚、蝸牛、玉米和稻穀。人工飼養時，為滿足亞馬遜泥龜生長所需要的各種營養，避免因飼料單一而生長發育不良和產生厭食症，應採用多種飼料，如動物性飼料中的魚蝦、蝸牛、河蚌等和植物性飼料中的稻穀、小麥、玉米等。
要想讓亞馬遜泥龜充分地消化這些飼料，在投喂飼料之前，須先將玉米、豌豆等壓碎，浸泡2小時左右，其他大塊食物也須先切碎，然後才投喂。還須注意的是，在亞馬遜泥龜生長的不同時期，應根據其生長特點投以含不同營養成分的飼料。
