常見的小蒼蘭病害有：小蒼蘭菌核病、小蒼蘭花葉病和小蒼蘭壞死斑病。
①小蒼蘭菌核病。 病原菌從葉鞘處侵入， 葉鞘呈淡褐色或淡黃褐色， 然後入侵莖基部和球根， 使之發生腐爛， 導致植株生長不良， 逐漸枯萎。 防治方法：用無病的球根繁殖， 多施有機肥少施氮肥和適當控制澆水量不讓土壤過濕， 可防止菌核病發生；病害發生後及時拔除病株集中銷毀， 並用70%甲基托布津1000倍液或50%的多菌靈1000倍液噴灑。
②小蒼蘭花葉病。 在小蒼蘭葉片上出現褐色條斑， 花瓣上出現退綠斑紋， 嚴重時葉片扭曲。 防治方法：用40%氧化樂果1500倍液或2.5%氯氰菊酯3000倍液及時噴灑，
③小蒼蘭壞死病斑。 小蒼蘭葉片上出現壞死斑或環斑或花葉、壞死斑。 防治方法：播種前消毒種球；生長期用40%氧化樂果1500倍液毒殺蚜蟲、或用呋喃丹等毒殺線蟲；發現病株， 及時拔除銷毀。
危害小蒼蘭的蟲害主要是油葫蘆。 油葫蘆的成蟲和幼蟲都能危害小蒼蘭的根、莖、葉。 成蟲喜歡躲藏在陰涼、潮濕疏鬆的土壤中或薄層積草內， 夜間出來覓食， 遇驚動逃避， 產卵于田埂雜草中和草堆邊緣的土中。
防治方法：①冬季結合翻土來滅殺越冬卵。 ②在草堆裡放入毒餌來誘殺成蟲， 毒餌一般用麥黻、米糠和高粱黻5千克， 炒成焦黃後拌入90%的敵百蟲1000倍液1000~2000毫升，
