扁尾陸龜外觀酷似蛛網龜，並且在一段時間內，人們一度認為扁尾陸龜是蛛網龜的某一亞種，但是現在的科學分類將其劃分出來，
扁尾陸龜可生長至13.7釐米，甲殼相當平坦，甲殼後面邊緣是尖銳的鋸齒，甲板的顏色是黑色的，成長後會慢慢變成淺棕色，甲與甲之間的邊緣會有淺棕色或黃色斑點。背甲與腹甲之間沒有鉸鏈，腹甲的顏色是黃色的，有褐色的斑點，斑點顏色較為暗淡。
頭部呈黃色而且有黑色斑點，但不同的個體差異是很大的。喙的上頜骨和下頜骨是黃色的，四肢呈淺棕色的。而尾巴是平的，因而得出扁尾陸龜的名字。
扁尾陸龜早前是歸納為蛛網龜屬中蛛網陸龜的亞種，其後才被獨立為蛛網龜屬中的另一種。扁尾陸龜居住乾燥的落葉林中，在雨季期間，它們在降雨後會立即積極活動，
