肥料在施用過程中有許多問題值得注意。 具體來說應該搞清楚哪些肥料能混施， 哪些不能混施。
碳銨與過磷酸鈣混合施用， 能使作物吸收到氮、磷等營養元素的同時還可中和過磷酸鈣中一部分游離酸， 消除其危害。 但應注意， 兩者混合比例要適當， pH值保持在微酸性至中性， 不可呈鹼性， 否則過磷酸鈣中的水溶性磷在鹼性環境中易轉化成難溶性磷， 從而降低肥效。
硝酸銨和氯化鉀混合後的生成物中， 有一部分為氯化銨和硝酸鉀， 它們比硝酸銨具有較好的物理性， 潮解性較小， 易於施用。
磷礦粉或鈣鎂磷肥與堆肥漚制。 有促進磷肥肥效的作用。 因堆肥中有機物分解後產生有機酸可使難溶解性磷肥轉化為易溶態。
過磷酸鈣和硝酸銨要隨混隨施， 或先用10%至20%的磷礦粉或5%的草木灰中和過磷酸鈣中的游離酸， 然後混合施用。
尿素與氯化鉀或過磷酸鈣混合， 可加入少量幹廄肥或幹泥炭(每500公斤肥料中加入50公斤)， 隨混隨用。
銨態氮肥或糞肥不能與鹼性肥料(如草木灰、鈣鎂磷肥等)混合， 否則易引起氮素揮發損失。
過磷酸鈣不能與鹼性物質混合。 否則會使可溶性磷酸變成弱溶性或難溶性磷酸， 降低磷的有效性。
硝態氮肥不宜和有機肥， 特別是未腐熟的有機肥混合， 因為有機肥中的五碳糖是硝酸還原細菌的最適養料，
