蛋白質是蛇龜營養中最重要的成分，是生長發育和維持生命的必需營養素，不僅是蛇鱷龜體組織和器官發育的物質基礎，而且對蛇鱷龜正常生理代謝，酶和激素生成以及提供能量等方面均起到重要作用，因此飼料動物蛋白源的多少是決定蛇鱷龜生長快慢的主要因素。在保證蛋白質基本數量前提下，龜生長快慢更取決於飼料蛋白質的品質，即飼料蛋白質所含氨基酸的種類和比例。因此，要配好優質的龜飼料，首先要選好優質蛋白源，而蛇鱷龜對飼料蛋白質的需要量隨著龜不同發育階段、飼料中蛋白質的品質，
2．飼料氨基酸的平衡和互補
蛇鱷龜不僅需要高含量蛋白質，而且要求高品質的蛋白質。蛋白質有20多種氨基酸組成，其中有10種氨基酸是龜不能自身合成的，必須由飼料提供，故稱必需氨基酸，包括賴氨酸、精氨酸、組氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸、蘇氨酸、色氨酸、蛋氨酸和苯丙氨酸。根據蛇鱷龜肌肉中氨基酸的測定分析，其肌肉中必需氨基酸的含量是較高的，故在配方設計中，除選用優質的白魚粉外還採用穀朊粉、酵母粉、複合動物蛋白與蛋白腖等多種蛋白源，同時添加0.25％蛋氨酸和0.5％賴氨酸，
