邊境牧羊犬有著一雙靈敏漂亮的耳朵，家長要保持邊牧耳朵的健康漂亮，就需要及時的進行護理。在邊牧的耳道內很容易聚集油脂、灰塵和水分，外部的耳毛容易滋生耳蟎等細菌，如果不及時清理就容易患上耳蟎疾病，耳道內沉積污垢而導致耳垢發炎感染。為避免這種情況，家長就要及時的護理邊境牧羊犬的耳朵，保證身體健康。
在護理邊牧犬之前，家長應該先診斷狗狗的耳垢是否嚴重。如果邊牧犬的耳垢不嚴重，那麼家長首先應該輕輕的用手將耳朵周圍的毛髮撥開，拉起狗狗的耳朵，用棉簽沾上一些甘油，塗抹在狗狗的外耳道上，然後用手捏捏邊牧犬的耳朵按摩一下耳根，使進入狗狗耳朵裡的油質分佈均勻，最後用棉棒或小棉球擦乾淨就可以了。
在護理的時候家長還應該注意，清洗的鑷子或者是棉簽不能插入耳道太深，在清理的時候，
此外，如果發現邊境牧羊犬的耳垢嚴重，耳朵有發炎的情況，那麼應該選擇帶它去看獸醫，同時選擇合適的藥物進行清洗消毒。一般來說對有炎症的耳道，家長可以選擇4%硼酸甘油滴耳液、2.5%氯黴素甘油滴耳液、可的松新黴素滴耳液等消炎滴耳液滴耳，一天三次，一次兩至三滴。當然，家長在選擇任何藥物之前，應該先徵求獸醫的建議，不能隨意用藥，避免用藥錯誤而導致更為嚴重的後果。
