眼斑水龜的外觀與四眼斑水龜很相似，很難區分和鑒別，確實是這樣，在正常情況下，如果龜縮在甲殼內是區分不出來的，
眼斑水龜，體型中等，成年龜甲長14釐米左右。頭背皮膚光滑，灰棕色，頭、背均佈滿棕黑色或鐵銹色蟲狀斑紋，頭後兩側各有1~2對眼斑狀花紋，有的頭頂還有蟲紋，兩對眼斑分界不清。背甲灰棕色，較平，具一縱棱。腹甲平坦，略與背甲等長，前緣平切，後緣略凹。四肢灰棕色．，前肢外側具若干大鱗。指(趾)間全蹼，前肢5爪，後肢4爪。尾細。
眼斑水龜背面色深，腹面色淺。眼斑水龜，頭頂的兩對眼斑界線清晰，背甲呈棕色，腹甲淡黃色並雜有黑色斑點。其他略與眼斑水龜同。體型適中。上喙不呈鉤狀，頭後側各有2對眼斑，每個眼斑中有一黑點，頸部有條縱紋。其背甲棕色且具花紋，
