龜屬於變溫動物，其呼吸，心率，血流速度，體溫都隨外界溫度的變化而變化，因此龜的新陳代謝高低和生長速度也隨溫度的變化而變化。
但氣溫在12度以下時龜的冬眠才真正開始。大部分龜是上岸冬眠，常常幾個龜聚集在一起，躲藏在沙地下、洞穴或乾草堆中，不食不動，呼吸，心率緩慢，四肢及頭部縮入殼中，完全靠體內的營養物質維持生命。但有少部分水棲龜類是在水下冬眠。龜在潛水時，除了利用肺中儲存的氧氣外，口咽腔（具豐富的毛細血管），泄殖腔內的副膀胱還可以利用水中溶解氧進行非肺呼吸。
冬眠時，龜以非肺呼吸為主。龜有較強的耐缺氧能力。在水下，龜通過糖哮解釋放能量進行厭氧代謝（與哺乳動物不同，龜是全身性的參與），其體液具備很高的緩衝能力，能忍受大量的乳酸累積及PH值降低。
龜的冬眠是從11月下旬一直延續到第二年4月中旬。
