飼養過薩摩耶犬的家長們應該都瞭解過，薩摩耶犬天生腸胃不好，容易患糖尿病和VKH綜合症，一旦患上這些疾病，薩摩耶犬精神開始變差，嚴重的更或奪走它的生命。除了這種危險的疾病，以下幾種疾病也是薩摩耶幼犬常見的。
一、脫毛症，也叫禿毛症。一般有先天性脫毛和後天性脫毛之分：
1.先天性脫毛症，主要是由於遺傳導致，先天性脫毛通常都很難治癒，這類的薩摩耶犬在日常的生活中更應該注意對毛髮的護理和清潔。
2.刺激性脫毛症，主要是甲狀腺功能減退，腎上腺皮質功能亢進、睾丸或卵巢功能障礙和支援細胞瘤的脫毛。
3.代謝性脫毛症，見於脂肪酸缺乏的脂溢性皮炎。
4.瘢痕性脫毛，這種情況多見於燒傷後疤痕處的脫毛。
5.中毒性脫毛症，比如嚴重的食物中毒影響了皮膚結構，出現皮膚炎疾病等，這類情況也會導致薩摩耶幼犬脫毛。
6.精神性脫毛症，
二、過敏性皮炎
主要是由於外界的跳蚤、蝨子、花粉、黴菌、寄生蟲、灰塵、化學物質等等因素，對狗狗皮膚的傷害。導致狗狗出現皮膚炎疾病。這類皮膚炎疾病經常瘙癢難忍，嚴重的會在皮膚表層結疤並且脫毛。這類疾病只要定期的給狗狗做身體清潔，梳理毛髮，為其提供一個乾淨舒適的生活環境，就完全可以避免過敏性皮炎的發生。
