1、病害：
(1)軟腐病：又稱細菌性褐斑病，多從根莖處侵染，也可發生於葉片上，初生水漬狀暗綠色小斑點，逐漸擴大呈褐色軟化腐爛狀，腐爛部位有分泌物流出，並伴有臭味。病菌可借澆水傳播。高溫高濕有利於病害發生，一旦發現感病植株應及時隔離銷毀，並用農用鏈黴素、波爾多液或甲基多硫磷等藥物防治。
(2)黑斑病：是危害石斛蘭的主要病害，發生部位為葉片。初期為褐色小斑點，以後擴大呈近圓形病斑，中心部壞死，病斑呈灰褐色，直徑0.5～1.0cm。發病嚴重時，病斑相連成片，造成葉片發黃而脫落。
2、蟲害：
(1)蚜蟲：主要危害石斛蘭幼嫩葉片、花蕾等，
(2)介殼蟲：石斛蘭栽培中的常見害蟲，主要寄生于葉背或葉鞘內。發生於空氣濕度低，通風較差的環境。危害初期葉片發黃，影響光合作用，嚴重時植株死亡或不能正常生長開花。除加強通風外，少量發生時，可用軟刷刷除。藥物防治採用50%馬拉硫磷或25%蚧死淨800～1000倍液每週噴施一次，連續噴施3～4次。
(3)蝸牛和蛞蝓：長期潮濕或梅雨季節比較多見。夜間爬出咬食石斛蘭的新芽或根尖，造成生長嚴重受阻。可以清除地面雜草、苔蘚;少量發生時進行夜間人工捕殺或地面及牆角撒生石灰驅殺;大面積發生時可用80%滅蝸靈或90%敵百蟲藥物來處理。
