巴西龜每年都有冬眠的習慣，一般從每年的9、10月份開始，它就需要為自己的冬眠做準備。當環境溫度低於15攝氏度時，巴西龜會開始進入冬眠。當環境低於5攝氏度時，就徹底進入冬眠。東面時期的巴西龜一動不動，而且只要保證環境溫度在4攝氏度以上，巴西龜就能順利、安全的度過冬眠。
巴西龜的冬眠季節一般從每年的11月開始一直持續到來年的3月份。冬眠時期的巴西龜會完全停止進食，它們會一直睡覺直到冬眠結束。巴西龜的抗寒性還可以，大多數情況下，它們都能順利安全的度過冬眠期，然後隨著氣溫的回升，開始慢慢的蘇醒，開始一年的新生活。
在巴西龜冬眠的時候飼養者應該注意。不要隨意的去吵醒巴西龜，為了保證巴西龜順利冬眠，家長可以將魚缸搬到室內，偶爾放在陽光照射的地方，曬1-2小時太陽，達到殺菌的目的，又可以促進巴西龜身體鈣質的吸收。
同時，巴西龜在冬眠的時候也不能離開水，因為離開水巴西龜就會生病，甚至是死亡。飼養者應將巴西龜放在有水的缸中過冬，而準備的水不要太多，水放到龜背即可。而且，還可在缸裡面放一塊方形磚或石塊，以保證巴西龜能順利的冬眠。
