系統繁殖是指公母雙方四代或五代血系裡， 有一隻以上的相同祖先， 而且雙親及三代內， 並無同一只重複出現， 這樣的方法就是系統繁殖法
它是一種較輕近親繁殖， 俄羅斯的高加索犬繁育者很多都採用了這種繁殖方式， 因為高加索犬系統繁殖降低近親繁殖帶來的危險， 有可以得到近親繁殖的效果。
採用系統繁殖時， 事先應該瞭解公母犬上五代至七代的血統， 這是絕對的參考價值。 （注：所以國外良好的血系記錄體制， 為高加索犬的繁殖起到了很好的作用， 國內的高加索愛好者和繁育者應該做好飼養犬的血統記錄。
假如準備配對的種犬祖先裡， 不斷的出現相同的祖先， 雖然在代數上不盡相同， 也可以把它們作為繁殖的傾向。 一般來說， 利用系統繁殖法， 繁育出的優秀高加索犬的比例也相當的大， 因為在繁殖時我們依據血統的記錄， 大約可以判斷出公母犬的遺傳傾向， 而加以利用， 祖輩的優秀特徵將有很大的機會在繁育出來的高加索犬身上重現。
母犬大約每年生育一次或者每八到十一個月。
高加索犬
母犬多數在秋天在野外的巢所產下幼犬。 牧人通常只保留公犬和一到兩隻母犬。 殺死一窩中剩餘的母犬。
一般只有20%的幼犬能夠存活至成年因為沒有人餵養它們照顧它們。 只有最健康的幼犬能夠生存下來。 在高加索地區， 人們沒有賣狗的習俗。 所以狗經常被高加索人當作禮物送給好友。
高加索人經常自己保留幼犬因為絕大多數高加索地區的狗不能活到很老。 所以替代繁殖是必需的。 有些牧人嘗試繁育最好的公犬而且有些人心裡明白公犬的譜系。
