野生環境下的馬達加斯加大頭側頸龜是雜食性動物，相對來說更喜歡食用一些軟體動物和魚蝦，
人工飼養環境下，馬達加斯加大頭側頸龜稚龜可以吃各種無脊椎動物、魚、顆粒狀的龜飼料和魚飼料。以及大量的水生植物。成龜則是植食性的，如果給它們顆粒飼料和蛋白質，它們也會接受。對於成體來說，無需定期提供高蛋白的食物。可以每週投喂一到兩次顆粒飼料，量不要多，其中陸龜飼料的比例要明顯地多於水龜飼料（後者含有較高的蛋白質）。水箱裡應該一直保持有充足的水生植物和綠葉蔬菜，而且品種也要多樣化。
馬達加斯加大頭側頸龜是世界上最為溫和的水龜之一，它們在游泳和覓食時的動作都非常優雅。它們能很好地適應人工飼養的環境，
