在薩摩耶犬的生命中也經常受到疾病的困擾。一些常見到疾病都經常出現在薩摩耶犬的生活中，嚴重威脅者寵物狗的身體健康，也嚴重影響了薩摩耶犬的正常生活。
骨關節發育不全是薩摩耶犬多發的骨關節疾病。當薩摩耶犬股關節發育不全的時候，因髖臼淺，關節不能夠非常好地吻合在一起，又因為大腿骨骨頭的形狀歪曲，因而不能夠完全咬合。當咬合進一步惡化的時候，關節完全脫落，便可能會出現骨關節脫臼。這種疾病的遺傳性的因素要占70%，剩下的30%是肥胖負擔重或者是肌肉不發達而引起的。
過敏性皮炎，當受到黴菌，灰塵，滿蟲，化學物質等多種的物質的影響時，會引起薩摩耶犬皮膚發炎的疾病。患病的薩摩耶犬頻繁搔撓，劇烈瘙養，偶爾會見啃咬患部。反復搔撓的部位會脫毛，皮膚會有抓傷，或是皮膚發黑，增厚。病犬不斷的舔毛，
糖尿病，初期尿量異常的增加，因尿量的增加而口渴，多飲。食欲旺盛，體重減輕，但是因初期水腫，不太容易被發現。輕症可以通過食療，運動控制血糖值。犬糧則要換成熱量低，抑制碳水化合物以及脂肪低的品種。血糖值高時或者是食療，運動均無法控制血糖的時候，必須要注射胰島素。這種情況之下，需要終生持續的注射胰島素。
為了預防這些常見的疾病來騷擾寵物狗，在日常生活中，飼養者還需要加強對薩摩耶犬的管理和照顧。保持薩摩耶犬有足夠合適的運動量，增強身體體質，來抵抗這些常見易患的疾病。
