種子採收後經過晾曬，選出子粒飽滿無病蟲害的進行貯存。貯藏時要注意分門別類，避免互相混雜。花卉種子的壽命，因種子成熟情況和貯藏條件而不同。有的種子不能貯藏，一貯藏便失去發芽率，如秧海棠等。一般花卉種子的生命力可以保持2～3年或更長時間。貯藏時間太久，不僅降低了發芽率，且發芽後生長力差。
花卉種子的貯存應該注意以下幾個方面：
保持乾燥 保持乾燥是防止種子變質的重要條件。含水率應保持在12%，才能使種子的生命活動穩定，一旦發現種子含水率過高，應立即翻曬，以防止其發熱、黴爛、受凍。
控制溫度 高溫會使種子呼吸作用增強，直接影響種子的品質和發芽率。在2℃～3℃的條件下保存可降低種子的呼吸頻率，從而保持種子有較長的生命力。
環境乾淨 種子貯藏室應打掃乾淨，用石灰堵塞裂縫和鼠洞，並用石灰水刷牆壁，再以適量化學藥劑消毒。家庭養花收貯的種子曬乾後可用布袋懸空掛在通風乾燥處，這是一種較妥善的貯存辦法。
採取不同貯存方法，有的種子適合濕藏，如南天竹、木瓜、桃花、梅花、薔薇等;而睡蓮、玉蓮的種子，則需要放入盛水的瓶中貯藏；芍藥、月季、桂花等種子需進行沙藏;還有些需要採用冰凍的方法貯存，如鴦尾、飛燕草、水蘇等;牡丹、白蘭花的種子要隨收隨種;還有一些核果類和種皮較硬的種子，
