花友在盆栽百合花種植過程中會遇到不少問題，下面的10條常見問題，是根據花友的回饋整理的，其中前兩項是花友遇到的比較集中問題。
1、球根腐爛：控制好澆水，寧幹勿濕由真菌引起，積水是主要誘因，發現時往往為時已晚，如果鱗莖盤完好可剝去腐爛鱗片，消毒儲藏，症狀多變，葉緣發黃，腳葉脫落，植株萎蔫且澆水不緩解，OT、LO、LA等的花苞發黑，生長明顯停滯等等，都極有可能是爛球。
2、消苞：常見於亞百，原因是光照不足(連綿陰雨，放在室內)。現象是小花苞由綠色變為棕色，之後枯焦，當年就不會開花了，繼續好好養球。
3、葉燒：濃肥，未腐熟的肥可能傷害根系，使葉片嚴重焦尖，花苞枯萎，這時要大水沖洗盆土，必要時翻盆換土，東百比較容易葉燒，注意澆水施肥中氯離子，氟離子要少 (過磷酸鈣一類的磷肥含量較多，慎用)。
4、折斷：同消苞處理，繼續養球，百合不會發側枝的，頂芽折斷意味著當年不開了。
5、腳葉發黃脫落：百合的通病，尤以東百和部分亞百為重，LA，LO，OT此現象不明顯，如果不嚴重基本不影響觀賞，可作為植株健康情況的反映。
6、蟲害：不多見，偶有介殼蟲，日本甲蟲，蚜蟲等侵害，蝸牛可能啃食花苞，地栽要注意防護。
7、灰黴病：常見於濕度特別大的溫室，和高溫多雨時，葉片上產生發黴樣病斑，用殺菌劑噴灑消除。
8、反季節發芽：對於鐵炮等特別強健的品種，有可能在冬天接近休眠時發出新芽，讓它長
9、不發芽：這是新手最害怕的情況，好在如果不是因為爛球、爛芽，這種情況很少見，常是種球經歷的冷期不夠還未打破休眠，這種情況可以放冰箱處理，
10、畸形芽，重瓣花：常出現在冷處理的秋季球，與冷處理時間過長有關，一般不影響種植。
