藍星魚在未達到性成熟之前,雌雄特徵不明顯,性別較難區別,仔細觀察才可以比較出來:
(1)體色:雄魚色澤比較鮮豔,而雌魚則比較黯淡;
(2)背鰭和腹鰭:雄魚背鰭比較大,背鰭和臀鰭後端呈尖狀,而雌魚背鰭比較小,背鰭和臀鰭後端則較圓鈍;
(3)腹部:雄魚腹部不飽滿,而雌魚腹部則較飽滿;
(4)絲狀胸鰭:雄魚絲狀胸鰭基部呈明顯桔紅色,而雌魚絲狀胸鰭基部不具明顯的桔紅色。
當受驚恐時,雌雄魚體上都會呈現不規則傾斜的條紋
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