魚類屬於水生動物，魚類寄生蟲按其所寄生的部位可以分為兩類：
1、體內寄生蟲。這類寄生蟲寄生在水生動物的內部器官、血液、腸道和其他組織中，如艾美蟲、各種絛蟲、血吸蟲等。
2、體外寄生蟲。這類寄生蟲寄生在水生動物的體表、鰓、鰭等處，如指環蟲、錨頭鰠、魚鯴等。
在選用抗寄生蟲藥物時，要瞭解和掌握該藥物對蟲體的作用機理，對寄生蟲的毒性以及在宿主體內的作用，只要選擇了合適的藥物給予最佳的藥量才能達到最好的治療效果，以免浪費藥物和傷害宿主。
寄生蟲藥物可以分為抗原蟲藥物、殺甲殼動物藥物、抗蠕蟲藥物和除害藥物。
