藍藻類和害蟲

飼育水缸如管理不當， 會產生藍藻和淡水性水螅（Hydra）， 也會出現混在生餌內的水蛭和扁蟲等害蟲。 通常健全的水缸不會產生藍藻， 也不能讓藍藻繁殖。 但是如果突然發生的話， 會以異常速度增殖， 放出惡臭的青綠色覆膜， 會窒息所有植物。

若產生藻類， 就要清掃玻璃面和器材， 積聚在底部的也要全部吸走。 然後， 控松底土， 放入食藻性的魚。 早期發現可以防止。 如果清隊不順利， 再度產生藍藻的話， 就要把缸騰空， 做掃除， 從頭開始整理。

淡水性水螅， 是和水母同類的腔腸動物， 附著於石頭和水草。

水蛭不太會攻擊魚類， 但是大量繁殖的話， 水質會惡性循環化， 它在水缸內搖晃游水的閻記， 實在令人作嘔。 若產生了這些東西， 要換掉全部的水， 一切器具都用或熱水消毒， 預防方法為仔細檢查生餌。