這類病比較常見，魚發病時，身體呈現粗糙狀態並變成淡黃色，遊的時候沒有方向感，失去平衡。一旦發病已經為晚期，無藥可以治，只有撈出發病魚，杜絕傳染。
（1）內臟黴菌病
發病的時候內臟腫大，不能吞食而肚脹。魚兒如有此病目前基本無藥可以治療，只有撈出。
（2）腐黴菌病
表現症狀為全身出現鬆軟的毛狀真菌。大多數因為海水老化而發生，注意更換海水。治療方式為將水溫提高到30C，可以痊癒。
五、魚兒腹瀉
海水魚的排泄物為細長，有很多的黏液；魚腹部腫脹，遊動時候出現半沉浮狀態。引起此病的可能是消化不良，
治療方式：斷食2天，並進行藥浴，用1顆四環素溶于18L水中，讓病魚生活在裡面，數天后可以康復。
六、眼腫病
有“突眼病”。病發的時候，一隻或兩隻眼睛突出，眼睛中出現氣泡般的微粒。這種情況應分析是藥物中毒引起還是水族箱太擁擠引起。如果是外傷，可以用人用的眼藥膏直接塗在患處。如無外傷，突出一隻眼睛可能就是柱狀細菌引起；兩隻眼睛突出可能是細菌感染也可能是寄生蟲。可以使用殺菌藥和殺寄生蟲藥物進行藥浴。
七、爛身或爛鰭
此類病是由於病原體引起的，病發時，魚身或魚鰭會有潰爛的現象。
治療方式：在18L海水中溶解1粒四環素或金黴素，把病魚放入，等魚好後放回水族箱。
魚兒的病種類還有很多種，在此也不多敘述。目前世面上也有很多海水魚的專用藥物，同時在水族箱內養一條醫生魚也能幫助中大型魚兒清楚寄生蟲，這是不錯的天然共生現象。在這裡有一些還是需要指出的：一般來說魚兒的疾病最好做到先預防，UV殺菌器是很重要的設備之一，可以説明水族箱起到比較完全的殺滅病毒、細菌、真菌等方面的作用，另一方面還是需要對新入缸的魚兒進行必要的檢疫，以防已病的新魚傳染給整個水族箱的所有魚類；最為重要的就是要保持好水族箱的水質優良，維持一定的狀態，最好不要在水族箱內直接用藥，這樣一方面是病魚痊癒了，但同時也把一些對海水生物有毒的物質帶入魚缸，
