錦鯉的健康管理在促進錦鯉生長的同時應確保錦鯉的健康， 合理餵食， 定期清洗過濾設備（主要是毛刷、過濾棉）保證各種設備的正常運轉以維持良好的水質、水體。
一、原則：錦鯉的疾病是“以防為主、防重於治、綜合防治”的方針。 日常管理中做好“四消”工作：即魚缸（池）消毒、魚體消毒、餌料消毒、食具， 工具消毒。
二、錦鯉魚病的早期發現
１、魚體表面的變化：觀察是否表皮充血；是否有白膜等現象。
２、離群：錦鯉離群獨處，
表示有病。
嚴重者游泳緩慢，
狀若夢游病患者，
更嚴重者無力控制游泳進退。
３、展開胸鰭靜止池底：錦鯉睡眠時合起胸鰭靜止在池底。 若生病時則展開胸鰭稍彎曲著身體無力地斜臥著， 稍加刺激就遊動。 但是一會兒又會再沉臥池底。
４、呼吸急促：錦鯉常浮在水面或屢次在水面呈深呼吸狀的則表示不正常
５、無食欲， 排糞異常:不攝食不一定是生病， 但應注意， 若見排糞呈液態漂浮于水中等現象時， 應注意， 錦鯉吃得過飽則會吐出嚼啐食物。
６、魚鰓腐爛；掀開魚鰓蓋， 會發現魚鰓變白或變黑， 甚至鰓絲部分缺損， 此為所謂的魚鰓腐爛病。
三、魚病治療方法
１、口服法：將藥劑混合在飼料中投喂的治療法。
２、藥浴法：主要是驅除體表寄生蟲及細菌性的外部疾病。
可將藥劑溶於魚池或將藥劑溶在水槽中然後將病魚放進水槽作藥水浴的方法。
３、局部治療：這是治療外傷以及身體表面的疾病時， 以高濃度的藥劑擦於生病部位。
４、注射治療法：用於治療細菌性疾病， 有肌肉注射和靜脈注射兩種方法。
５、手術治療法：魚鰭外傷或變形施以整形手術等。
