氨化作用與氨的累積

氨化作用是指魚排泄物（如糞便）或殘餌， 經由「氨化細菌」（異營性細菌之一）分解之後， 將其中可利用之殘留蛋白質轉化成氨之作用。 經由氨化作用之運作， 可將排泄物及殘餌清除， 但卻將副產的氨釋放于水中， 它可能對魚類造成嚴重的傷害。 所幸， 藉由硝化細菌之硝化作用， 能把水族缸所衍生的氨消除， 最後讓水質得以有獲得淨化之機會。

氨化作用是由氨化細菌來執行的， 這類細菌能在水族缸中自生。 由於它們的生長及繁殖速度極為快速， 在水族缸中能迅速形成龐大的族群，

並能夠很有效率地分解有機廢物， 使有機污染指數（如BOD）得以降低， 不過卻將氨直接排泄于水中。 這時候如果沒有足夠的硝化細菌數量， 藉以發揮更高效率的硝化作用， 把這些氨及時消除掉， 那麼氨的生產速度必快於被消費速度， 易使氨在水族缸中造成累積現象， 進而發生毒害問題。

在水族缸中， 硝化細菌的來源， 就如同氨化細菌一般亦能自生， 而且也能形成另一龐大的族群， 不過這得需要一些時間才行！因為硝化細菌的生長及繁殖速度相當緩慢（比長在玻璃上的青苔還慢）， 所以在魚類放養初期， 經常無法繁殖出足夠硝化細菌數量， 藉以進行有效率的除氨功能。 職是之故， 魚類發生氨中毒事件， 主要是在魚類放養初期造成的（新缸症候群）。

例如， 有些人把新買的魚， 一次悉數放養至新佈置的水族缸中， 大約過了一星期之後， 魚就開始一隻只的暴斃， 雖然令人感到有些心疼， 不過會發生這事件可是一點也不意外。