蛇的眼睛看似明亮，但是實際上它們的視覺并不好，可以說就是個近視眼。同樣的它們的聽覺也不出眾，
與視覺和聽覺不同，蛇的嗅覺很敏銳，它的主要嗅覺器官是由鋤鼻器和生長在口腔內的舌頭共同組成。蛇的鋤鼻器有一對，位于口腔頂部腭骨前方深凹處，通過嗅覺神經與腦神經相連。但是鋤鼻器并不與外界相通，要實現它的嗅覺功能，必須借助于舌頭。蛇的舌頭義叫“蛇信子”，細長有分叉，總是不停地吞吐著，特別是在爬行的時候，舌頭吞吐得更快，樣子令人畏懼，常被人們誤認為是有毒器官，實際上它并沒有毒。舌頭的基部有舌鞘，鞘內可以容裝整條舌頭，當舌鞘收縮時，舌頭迅速從鞘內彈出。所以，蛇不用張口即可以吐舌。
蛇雖然不是唯一的無足動物，但卻是無足動物中爬行最出色的。蛇無足，行動卻自如、快速、敏捷，這是因為蛇的整個身體都是運動器官。因蛇的脊椎骨很多，且短而寬，每個脊椎骨都與肌肉和鱗片相連，并且相鄰的脊椎骨可相對上下彎曲28度，左右擺動50度，把這兩者結合起來，就形成了蛇獨特的纏繞功能。再者，蛇脊柱兩側各有一組肌肉，一側收縮時，另一側舒張，這種一張一弛的波浪式運動能從頭至尾在身體兩側及相反位置傳遞。如果這種波浪式運動在傳遞過程中沒有遇到阻礙物，這些肌肉活動所形成的彎曲就會毫無阻力地通過傘身；但如果地面凹凸不平或坎坷狹窄，
蝮蛇科的毒蛇，如蝮蛇、五步蛇、竹葉青、烙鐵頭等，在頭部兩側鼻孔與眼之間各有一凹陷，稱為“頰窩”。頰窩系上頜骨的深凹，前寬后窄呈三角形，有一頰窩膜把它分成里外兩部分，外面由一個小孔與空氣接觸。薄膜上布滿神經末梢，對紅外線特別敏感，故義被稱為“熱感應器”。能辨別來自輻射面小于0.1-0.3℃的溫差變化，并且能準確地確定方位。
頰窩不僅有助于蛇類覓食和躲避天敵，而且更有利于雄蛇求偶，找尋同種雌蛇交☆禁☆配。具有頰窩的毒蛇有撲明火的習性，所以夜間明火照明在野外行走應特別小心，以免被咬傷。
蛇的神經系統包括中樞神經和外周神經兩部分。中樞神經由腦和脊髓構成，是蛇類的支配系統。外周神經由腦神經和脊神經構成，是一種感覺、運動神經。蛇類神經系統不發達，不過有著較好的應急反應，已能適應各種比較高級的活動。
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