水族箱內植草養魚的小生態環境， 水質、水環境發生轉化， 主要是魚糞、殘餌沉積， 水質混濁， 有機物耗氧， 或者藻燈旺盛， 水草的光合作用受影響；水的理化性質發生變化， 等等， 因而使水質不符合魚和水草的要求。
解決辦法是使用篩檢程式排汙；沒有濾水器時， 用虹吸管排汙和加入新水。 開動濾水器或使用吸管汙換水的間隔時間， 視具體情況掌握。 如魚少積糞少， 水溫不高， 水的理化性質變化慢， 水清， 間隔時間可以長些。 屬於經營性的， 魚密度大的水族箱， 以及飼養大型魚、高氧魚，
水族箱內的魚糞、剩餌隨水流出過濾層後， 便附積在化纖棉或砂層上， 設有活性炭、沸石等物的， 還將可溶性物質吸附， 降低水的硬度。 活性炭需放在過濾棉的下面， 否則容易被汙物堵塞， 失去吸附力， 過濾棉應常用清水漂洗， 清洗中不可用洗衣粉或肥皂， 必要時可用洗潔精（洗餐具、蔬菜、水果用的）。 當箱內的水量減少， 應及時加入。
用吸管排汙， 一般每週1－2次， 如養的魚多， 夏季水溫高， 水質變化快， 可以增加1－2次。 每次兌換水量可在1/5以上， 一般少量兌換為宜。
在天然水域中的水所以能自淨， 因素之一是有光合菌的存在，
