防衛的正確含義是避免和阻止襲擊，這是德國牧羊犬工作能力表現最為突出的方式。簡單的說，經過嚴格防衛訓練的德國牧羊犬，它們會更懂得什麼時候該咬什麼時候不該咬。它們的防衛判斷能力得到了加強，在執行任務中也避免了惡意攻擊的不良情況。那麼，德國牧羊犬防衛訓練的方法是怎樣呢？
德牧犬的防衛訓練都包括三個部分：第一，按指定路線行走；第二，口令服從；第三，基本防衛技術。
1.指定路線搜尋是防衛訓練的第一步。確定德國牧羊犬的行走路線非常簡單，只要一個人在一塊普通的土地或草地上走上一段距離就可以。當然，這條路應該是事先佈置好的，然後用一條10米長的皮帶牽引著德國牧羊犬，把皮帶放開（牽著頭）讓德牧嗅出被佈置在路上的一些小物件。以提高德牧犬接受訓練的能力、嗅覺能力，以及犬的心理素質和身體耐力。
2.口令服從主要是進行一系列的跟隨性訓練。讓德牧犬緊緊的跟隨主人，在訓練過程中可以出現突發的響聲，此時注意要引導德牧保持一種穩定。同時，服從訓練的大致內容還有坐下、臥倒、起立等。通過這種訓練，提高德國牧羊犬的服從性。
3.基本防衛技術的訓練重點是考驗德國牧羊犬的勇氣、體力和敏捷性，以及犬主對犬的控制。例如，搜尋隱蔽物、發現隱藏人、看守目標等待主人到達、追逐逃跑目標且死死地咬住逃跑目標等等。通過這一系列的訓練，提高德國牧羊犬的防衛能力。
