從目前養殖實踐來看，巴西龜的抗病力較強，只要做好早期引種及防病措施，採取合理的飼養模式，發現病龜及時隔離並積極治療，即會獲得較好的養殖效益。
1、預防龜病發生一般與環境、龜體本身和飼料、病原有關。保持良好和養龜環境，如水質符合養殖要求，周圍安靜，龜的棲息地合理而科學等，能減少龜病的發生。同樣，引種時就近進種，避免長途運輸，避免從市場上或不熟悉養殖近況的場家進種，龜種體格健康、無缺陷，飼料滿足龜生長需要、新鮮、全面而營養豐富。切斷病原傳播給健康龜的途徑等，
2、治療
(1)白眼病
病因：由於人工養殖時，密度較高，引起龜外傷或水質惡化等原因，巴西龜的稚、幼龜階段較易感染上白眼病。
症狀：病龜眼部發炎充血，逐漸變成灰白色而腫大，眼角膜及周圍因炎症糜爛，眼球外部被一層白色分泌物蓋住。發病後的龜，常用前肢擦眼部，不能攝食，嚴重時雙目失明，呼吸困難，身體瘦弱而死。
防治方法：加強飼養管理，重點做好消毒工作。對龜及養龜水體、食具嚴格消毒；加強龜飼料的營養成分，增強龜抗病能力。病龜用40 ppm 紅黴素溶液浸泡60分鐘；用金黴素眼膏塗病龜眼部。
(2)腸胃炎
病因：多為飼料變質或食具、水體受大腸桿菌等病菌污染而致龜患病。
症狀：病龜目光呆滯，
防治方法：改善水質狀況，保持水質清新，投喂新鮮飼料，食具嚴格消毒。病龜用30 ppm 紅黴素溶液浸泡60分鐘後，在飼料中拌入適量土黴素投喂病龜。
(3)腐甲病
病因：甲殼受損後，細菌侵入傷口導致甲殼腐爛。
症狀：表層甲殼腐爛，或形成洞穴甚至可見肌肉，不食，少動。
防治方法：用40 ppm 高錳酸鉀溶液浸泡病龜15分鐘後，再用微量高錳酸鉀結晶粉輕輕塗於病龜病灶部位。
(4)越冬死亡症
病因：多因越冬前營養缺乏，體質弱以致無法抵禦長期寒冷侵襲而死。少部分產後親龜及有慢性疾病的龜因越冬而致亡。
症狀：越冬前，龜體消瘦，肌肉乾癟，
防治方法：南方地區，每年7-8月開始，尤其是親龜產卵停止後，逐漸加強精飼料如肉類等的投喂，添加適量微量元素，使龜體質恢復，儲存足夠營養過冬。病龜抓緊治癒；稚龜宜採取一定保溫措施過冬。
(5)體內外寄生蟲
病因：多因長期棲息于水中，導致蜱、蚤、錐蟲等寄生於龜體表或內臟。
症狀：龜體表有蟲體、消瘦。
防治方法：立即清除體表蟲體，並用硫酸銅溶液(0.5毫克/升)浸泡30分鐘，每半年喂一次腸蟲清。
四、敵害預防
巴西龜稚、幼龜階段更易受蛇、鼠、貓等侵襲，因此宜用設施防止敵害。在池塘養殖中，注意搭養魚種的品種與規格，以免危害龜的安全。
