多年的實踐證明，再健康的鱉，總難免帶有一些病原菌。因此，清塘消毒過的池塘，如果放養未消毒的鱉，就把病原體一併帶入。一旦環境適宜，就會大量繁衍，導致疫病發生。從“以防為主”出發，切斷傳染途徑，在鱉運輸後下塘、倒池、分養前，都要進行消毒。
1．高錳酸鉀浸洗：用於防治各種體表寄生蟲病，浸洗濃度40毫克/升，水溫10～20℃時，浸洗15分鐘，水溫30℃左右時浸洗5～10分鐘。配製此藥時應現配現用，浸洗的水應儘量選用含有機質少的清水，防止在陽光直射下浸洗，以免影響藥效。
2．漂白粉浸洗：浸洗濃度10～20毫克/升，消毒時間視水溫高低、鱉活動情況靈活掌握，
3．食鹽浸洗：這是最常用的一種鱉體消毒方法。使用2％～4％的食鹽水浸洗10分鐘左右，可以用來殺死體表寄生蟲如鐘形蟲、水蛭等。
4．食鹽和小蘇打浸洗：用0.5‰的食鹽和0.5‰的小蘇打混合液浸洗稚、幼鱉10小時左右，可預防毛黴和水黴病。
