每位水族主人都希望自己的水族寵物能夠健康美麗，但是在日常生活中，還是有很多無法預防的疾病危害孔雀魚。針對孔雀魚常見易患的疾病，每位飼養者應該如何去預防和治療呢？
爛鰭病：往往因過量餵食，過久換水而使水質惡化，導致魚鰭邊緣脫落，行動遲緩。公的孔雀魚往往因水質驟變而使得寬大的三角型尾巴縮成為尾巴。治療方法：應先換水一半，如此進行5-8天后視情形再予治療。餵養孔雀魚首重、勤換水，平時更應定期清洗過濾棉以免病菌滋生。
水黴菌：由黴菌之寄生所引起的病症。病魚頭部、鰭基部、或魚卵表面皆為此黴菌的，故稱為水黴或魚黴。此黴菌喜歡藉外傷而入侵魚體寄生，輕者外皮擦破，重者可致筋肉破。治療方法：發現初期用甲基藍治療最有效，用法每0.1公克甲基藍溶液與10公升水混合使用.用食鹽，以濃度高達1%-1.5%的食鹽水將病缸泡水2-3天即可殺死病原。
腹水症：病魚外觀有如立鱗病之孔雀魚，其腹部雖未受精懷孕但仍肥大，嚴重者將水腫至死。治療方法：因餵食過量未消毒的絲蚯蚓所致。絲蚯蚓可用微量福馬林消毒之，唯應切記使用大量清水洗淨，以免誤傷健康魚只。
立鱗病：病魚症狀為魚鱗聳立，嚴重者類似一團棉花球，魚身腫脹、食欲欠佳、活動停止，並靜止在水底不動一直到死；止病狀多半發生在，曾以活的絲蚯蚓為主食的孔雀魚母魚身上，通常發病之前兆是水族箱已多日未曾換過新水所致。治療方法：所有活餌宜充份消毐，平日更應勤加換水。
白點病：是所有的魚類皆可能染上此疾病。患病的魚早期會因全身痛養而感到不舒服，
